在他前往位于印度、尼泊尔交界处的扬列穴山洞时，遇见了某位尼泊尔王的公主释迦天女（shakya devi），将她纳为修持所依与明妃。当他在修行清净黑噜嘎（vishuddha heruka）时，有三个大力鬼神制造魔障，使当地三年不降雨且疾病、饥荒横行。莲师派遣使者到印度询问其上师，应用何法来对治这些魔障。两名使者带回了普巴的教法，当两人回返尼泊尔的当刻，这些障碍就自动平息了。莲师和明妃证得了殊胜的成就，住于大手印持明的果位。莲师认为修持清净黑噜嘎能证得大成就，但此修法就像行旅的商人，会碰到诸多障碍；而普巴法则似不可或缺的护卫。为此，莲师写下来许多融合两者的仪轨，同时也誓令了普巴金刚的十六位世间护法。莲师还造访其他古国以弘传佛法，如邬金国近邻的胡穆祖、希科贾惹、达玛科夏、茹玛、提惹胡提、卡玛茹帕、坎恰……等诸多国家。他前往卓汀地方定时间并不可考，但他在当地所传下的《喜金刚》、《密月明点》（guhyachandra bindu）、《清净黑噜嘎》、《马头明王》、《普巴》和《本母》（mamo）等法，至今依旧流传着。一般认为莲师居住在印度三千六百年，传法利众。但学者们似乎持一半年限的看法，这仅是概数。为了调伏蒙古和中国的众生，莲师化身为国王陈永协（ngonshe chen）和瑜伽士圆灯（tobden）.他也在象雄示现为神变降生之童子塔维·哈察（t**i hricha），传授大圆满口耳传承的教法，引领许多具德的弟子证得虹光身。依此，莲师在各地示现、化身种种、说各种语言以引领众生步入解脱之道的事业，是在是难以计量。

接着叙述莲师入藏的经过。当文殊菩萨化身的赤松德贞王二十岁时，他发下大愿要广布佛法圣教。他从印度应请了菩萨堪布（菩萨堪布较常见的名字是寂护大师，是替西藏第一批出家僧侣剃度的印度大师），传授十二因缘和十善行。一年以后，当大寺的地基打好时，西藏的群魔作乱，阻碍建寺的进行。依据堪布的预言，赤松德贞王派了五名飞毛腿去迎请大师莲花生入藏。莲师早已预知此事，于是抵达西藏、尼泊尔边境的芒玉，在前往卫藏的途中，他取道纳日、苍（译注：今日的后藏地区）和多康（译注：今日的安多与西康）等地，神变地遍访各地，令十二地母、十三歌神、二十一居士神和许多大力鬼神誓为护法。